HalfsibMS

多地点半同胞子代测定遗传模型分析R语言程序包HalfsibMS 1.0

王德源( wcndy2007@163.com);童春发( tongchf@njfu.edu.cn)
南京林业大学林木遗传与生物技术重点实验室
2014/9/1

HalfsibMS是用于计算平衡或不平衡数据条件下林木多地点或单地点半同胞子代测定遗传参数的R语言程序包,主要针对以下两个遗传统计分析模型。

多地点模型: \(f\)个家系,布置在\(s\)个地点进行试验,每个地点设置\(b\)个区组,每小区若干个单株,则单株的数量性状值可用线性模型表示为: \[ y_{ijkl}=\mu+S_i+SB_{ij}+F_k+SF_{ik}+SBF_{ijk}+e_{ijkl} \] 单地点模型: \(f\)个家系,在某一个地点设置\(b\)个区组进行子代试验,每小区若干个单株,则单株的数量性状值可用线性模型表示为: \[ y_{ijk}=\mu+B_i+F_j+BF_{ij}+e_{ijk} \]

对于以上林木多地点或单地点半同胞子代测定遗传统计分析模型,HalfsibMS分别针对固定效应模型和随机效应模型计算相关的遗传参数。对于固定效应模型,基于约束线性模型方法,HalfsibMS计算了亲本一般配合力及其假设检验的统计量;对于随机效应模型,基于混合线性模型方法,给出了遗传方差分量及其假设检验统计量的计算结果,同时还计算出单株遗传力和家系遗传力以及不同性状间的遗传相关系数。HalfsibMS程序包、示例数据及使用说明可免费下载使用:

*     HalfsibMS 1.0 for Windows 

*     HalfsibMS 1.0 for Linux 

*     Example data 

*     Manual